Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Col17a1Q07563 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Col17a1Q07563 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms