Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms