Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf4Q06507 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms