Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms