Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a1Q05722 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col9a1Q05722 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms