Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms