Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox8Q04886 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox8Q04886 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox8Q04886 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms