Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Emx1Q04742 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Emx1Q04742 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Emx1Q04742 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Emx1Q04742 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Emx1Q04742 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Emx1Q04742 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Emx1Q04742 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Emx1Q04742 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Emx1Q04742 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Emx1Q04742 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms