Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk16Q04735 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdk16Q04735 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms