Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nf1Q04690 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms