Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcr5Q04683 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms