Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tff2Q03404 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tff2Q03404 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tff2Q03404 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tff2Q03404 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tff2Q03404 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tff2Q03404 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tff2Q03404 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tff2Q03404 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tff2Q03404 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tff2Q03404 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tff2Q03404 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tff2Q03404 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tff2Q03404 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tff2Q03404 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tff2Q03404 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tff2Q03404 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tff2Q03404 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tff2Q03404 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tff2Q03404 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tff2Q03404 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tff2Q03404 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tff2Q03404 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tff2Q03404 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tff2Q03404 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tff2Q03404 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tff2Q03404 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tff2Q03404 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tff2Q03404 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tff2Q03404 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tff2Q03404 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tff2Q03404 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tff2Q03404 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tff2Q03404 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tff2Q03404 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tff2Q03404 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tff2Q03404 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tff2Q03404 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tff2Q03404 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tff2Q03404 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tff2Q03404 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tff2Q03404 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tff2Q03404 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tff2Q03404 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tff2Q03404 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tff2Q03404 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tff2Q03404 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tff2Q03404 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tff2Q03404 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tff2Q03404 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tff2Q03404 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tff2Q03404 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tff2Q03404 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms