Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms