Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GscQ02591 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GscQ02591 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GscQ02591 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GscQ02591 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GscQ02591 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GscQ02591 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GscQ02591 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GscQ02591 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GscQ02591 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GscQ02591 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GscQ02591 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GscQ02591 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GscQ02591 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GscQ02591 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GscQ02591 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GscQ02591 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GscQ02591 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GscQ02591 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GscQ02591 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GscQ02591 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GscQ02591 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GscQ02591 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GscQ02591 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GscQ02591 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GscQ02591 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GscQ02591 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GscQ02591 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GscQ02591 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GscQ02591 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GscQ02591 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GscQ02591 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GscQ02591 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GscQ02591 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GscQ02591 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GscQ02591 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GscQ02591 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GscQ02591 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GscQ02591 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GscQ02591 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GscQ02591 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GscQ02591 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GscQ02591 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GscQ02591 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GscQ02591 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GscQ02591 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GscQ02591 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GscQ02591 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GscQ02591 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GscQ02591 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GscQ02591 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GscQ02591 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GscQ02591 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GscQ02591 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GscQ02591 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GscQ02591 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GscQ02591 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GscQ02591 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GscQ02591 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GscQ02591 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GscQ02591 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GscQ02591 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GscQ02591 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GscQ02591 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GscQ02591 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GscQ02591 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GscQ02591 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GscQ02591 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GscQ02591 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GscQ02591 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GscQ02591 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GscQ02591 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GscQ02591 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GscQ02591 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GscQ02591 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GscQ02591 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GscQ02591 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GscQ02591 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GscQ02591 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GscQ02591 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GscQ02591 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GscQ02591 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GscQ02591 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GscQ02591 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GscQ02591 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GscQ02591 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GscQ02591 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GscQ02591 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GscQ02591 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GscQ02591 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GscQ02591 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GscQ02591 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GscQ02591 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GscQ02591 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GscQ02591 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GscQ02591 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GscQ02591 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GscQ02591 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GscQ02591 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GscQ02591 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms