Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Muc1Q02496 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Muc1Q02496 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Muc1Q02496 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Muc1Q02496 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Muc1Q02496 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Muc1Q02496 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Muc1Q02496 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Muc1Q02496 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Muc1Q02496 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Muc1Q02496 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Muc1Q02496 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Muc1Q02496 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Muc1Q02496 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Muc1Q02496 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Muc1Q02496 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Muc1Q02496 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Muc1Q02496 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Muc1Q02496 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Muc1Q02496 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Muc1Q02496 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Muc1Q02496 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Muc1Q02496 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Muc1Q02496 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Muc1Q02496 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Muc1Q02496 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Muc1Q02496 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Muc1Q02496 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Muc1Q02496 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Muc1Q02496 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Muc1Q02496 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Muc1Q02496 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Muc1Q02496 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Muc1Q02496 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Muc1Q02496 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Muc1Q02496 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Muc1Q02496 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Muc1Q02496 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Muc1Q02496 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Muc1Q02496 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Muc1Q02496 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Muc1Q02496 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Muc1Q02496 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Muc1Q02496 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Muc1Q02496 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Muc1Q02496 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Muc1Q02496 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Muc1Q02496 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Muc1Q02496 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Muc1Q02496 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Muc1Q02496 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Muc1Q02496 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Muc1Q02496 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Muc1Q02496 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Muc1Q02496 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Muc1Q02496 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Muc1Q02496 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Muc1Q02496 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Muc1Q02496 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Muc1Q02496 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Muc1Q02496 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Muc1Q02496 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms