Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnb1Q02248 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms