Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdcd1Q02242 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdcd1Q02242 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdcd1Q02242 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdcd1Q02242 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdcd1Q02242 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdcd1Q02242 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdcd1Q02242 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdcd1Q02242 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdcd1Q02242 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdcd1Q02242 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdcd1Q02242 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdcd1Q02242 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdcd1Q02242 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pdcd1Q02242 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pdcd1Q02242 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pdcd1Q02242 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pdcd1Q02242 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pdcd1Q02242 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pdcd1Q02242 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdcd1Q02242 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms