Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms