Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ly9Q01965 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms