Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Grin2cQ01098 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Grin2cQ01098 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms