Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Grin2bQ01097 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms