Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms