Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms