Protein–RNA interactions for Protein: P97861

Krt86, Keratin, type II cuticular Hb6, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt86P97861 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt86P97861 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt86P97861 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt86P97861 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt86P97861 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt86P97861 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt86P97861 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt86P97861 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt86P97861 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt86P97861 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt86P97861 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt86P97861 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt86P97861 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms