Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms