Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Meis3P97368 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Meis3P97368 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Meis3P97368 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Meis3P97368 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis3P97368 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis3P97368 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Meis3P97368 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Meis3P97368 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis3P97368 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis3P97368 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis3P97368 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis3P97368 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms