Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SmsP97355 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SmsP97355 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SmsP97355 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SmsP97355 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SmsP97355 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SmsP97355 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SmsP97355 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SmsP97355 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SmsP97355 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SmsP97355 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SmsP97355 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SmsP97355 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SmsP97355 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SmsP97355 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SmsP97355 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SmsP97355 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SmsP97355 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SmsP97355 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SmsP97355 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SmsP97355 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SmsP97355 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SmsP97355 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SmsP97355 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SmsP97355 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SmsP97355 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SmsP97355 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SmsP97355 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SmsP97355 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SmsP97355 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SmsP97355 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SmsP97355 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SmsP97355 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SmsP97355 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SmsP97355 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SmsP97355 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SmsP97355 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SmsP97355 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SmsP97355 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SmsP97355 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SmsP97355 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmsP97355 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SmsP97355 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SmsP97355 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SmsP97355 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SmsP97355 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SmsP97355 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SmsP97355 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SmsP97355 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SmsP97355 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SmsP97355 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SmsP97355 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SmsP97355 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SmsP97355 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SmsP97355 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SmsP97355 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SmsP97355 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SmsP97355 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SmsP97355 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SmsP97355 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SmsP97355 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SmsP97355 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SmsP97355 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SmsP97355 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SmsP97355 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SmsP97355 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SmsP97355 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SmsP97355 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SmsP97355 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SmsP97355 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SmsP97355 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SmsP97355 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SmsP97355 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SmsP97355 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SmsP97355 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SmsP97355 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SmsP97355 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SmsP97355 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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