Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vgll3P85442 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vgll3P85442 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms