Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubg1P83887 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms