Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms