Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx2P81066 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx2P81066 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx2P81066 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx2P81066 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx2P81066 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx2P81066 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx2P81066 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx2P81066 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx2P81066 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx2P81066 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx2P81066 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms