Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptprn2P80560 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptprn2P80560 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptprn2P80560 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ptprn2P80560 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms