Protein–RNA interactions for Protein: P80315

Cct4, T-complex protein 1 subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct4P80315 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cct4P80315 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cct4P80315 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cct4P80315 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cct4P80315 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cct4P80315 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cct4P80315 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cct4P80315 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cct4P80315 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cct4P80315 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cct4P80315 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cct4P80315 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cct4P80315 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cct4P80315 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cct4P80315 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cct4P80315 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cct4P80315 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cct4P80315 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cct4P80315 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cct4P80315 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cct4P80315 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cct4P80315 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cct4P80315 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cct4P80315 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cct4P80315 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cct4P80315 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms