Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2-Q6P79568 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms