Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Fgf11P70378 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgf11P70378 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms