Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufd1P70362 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms