Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms