Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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