Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta1P68134 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta1P68134 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta1P68134 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta1P68134 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta1P68134 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Acta1P68134 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta1P68134 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Acta1P68134 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acta1P68134 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acta1P68134 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acta1P68134 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acta1P68134 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acta1P68134 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms