Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms