Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms