Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps27aP62983 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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