Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab1AP62821 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab1AP62821 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab1AP62821 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab1AP62821 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab1AP62821 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab1AP62821 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab1AP62821 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab1AP62821 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab1AP62821 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab1AP62821 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab1AP62821 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab1AP62821 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab1AP62821 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab1AP62821 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab1AP62821 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab1AP62821 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab1AP62821 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab1AP62821 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab1AP62821 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab1AP62821 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab1AP62821 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms