Protein–RNA interactions for Protein: P62743

Ap2s1, AP-2 complex subunit sigma, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap2s1P62743 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap2s1P62743 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap2s1P62743 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms