Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf6P62331 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf6P62331 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arf6P62331 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arf6P62331 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arf6P62331 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms