Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm5P62322 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms