Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpeP62305 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpeP62305 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpeP62305 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpeP62305 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpeP62305 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpeP62305 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpeP62305 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpeP62305 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpeP62305 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpeP62305 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpeP62305 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms