Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms