Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnnP61807 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SnnP61807 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SnnP61807 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SnnP61807 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SnnP61807 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SnnP61807 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SnnP61807 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SnnP61807 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SnnP61807 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SnnP61807 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SnnP61807 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SnnP61807 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SnnP61807 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SnnP61807 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SnnP61807 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SnnP61807 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SnnP61807 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SnnP61807 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SnnP61807 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SnnP61807 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SnnP61807 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SnnP61807 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SnnP61807 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SnnP61807 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnnP61807 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnnP61807 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnnP61807 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnnP61807 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnnP61807 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnnP61807 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnnP61807 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnnP61807 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnnP61807 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnnP61807 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SnnP61807 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnnP61807 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SnnP61807 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SnnP61807 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SnnP61807 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SnnP61807 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SnnP61807 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SnnP61807 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SnnP61807 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SnnP61807 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SnnP61807 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SnnP61807 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SnnP61807 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SnnP61807 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SnnP61807 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SnnP61807 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SnnP61807 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SnnP61807 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SnnP61807 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SnnP61807 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SnnP61807 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SnnP61807 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SnnP61807 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SnnP61807 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SnnP61807 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SnnP61807 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SnnP61807 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SnnP61807 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SnnP61807 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SnnP61807 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SnnP61807 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SnnP61807 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SnnP61807 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SnnP61807 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SnnP61807 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SnnP61807 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SnnP61807 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnnP61807 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnnP61807 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnnP61807 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnnP61807 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnnP61807 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnnP61807 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnnP61807 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnnP61807 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnnP61807 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnnP61807 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnnP61807 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnnP61807 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnnP61807 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnnP61807 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnnP61807 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnnP61807 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnnP61807 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnnP61807 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnnP61807 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnnP61807 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SnnP61807 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnnP61807 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnnP61807 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnnP61807 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SnnP61807 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SnnP61807 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SnnP61807 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SnnP61807 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms