Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Depdc5P61460 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Depdc5P61460 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms